Ce test de crachat promet de dire aux couples leur risque de transmettre des maladies courantes

Mme Tech | Unsplash, Getty

Une nouvelle startup appelée Orchidée offre aux couples qui planifient une grossesse la possibilité de connaître leurs chances de transmettre les risques de maladies courantes comme la maladie d'Alzheimer, les maladies cardiaques, le diabète de type 1 et 2, la schizophrénie et certains cancers à leur futur enfant.

Les tests de préconception existants, qui sont largement disponibles, peuvent dire aux parents si leurs enfants pourraient avoir certains troubles héréditaires causés par des mutations dans un seul gène. Mais ces troubles monogéniques, qui comprennent fibrose kystique , drépanocytose , et Tay Sachs , sont relativement rares.

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Le test d'Orchid, en revanche, examine des maladies beaucoup plus courantes qui sont influencées par une combinaison de plusieurs gènes, souvent au nombre de centaines. Les couples passent le test à la maison en crachant dans un tube et en l'envoyant par la poste. La société séquence les génomes de chaque parent et utilise des ensembles de données de personnes avec et sans ces maladies pour calculer leurs risques. Le résultat est connu sous le nom de score de risque polygénique .

Plus tard cette année, la startup prévoit également de commencer à proposer des tests d'embryons, qui consisteront à extraire quelques cellules d'embryons créés par fécondation in vitro, à séquencer leur ADN et à générer des rapports de risque similaires. Les couples subissant une FIV peuvent déjà faire tester leurs embryons pour les anomalies chromosomiques et les troubles monogéniques, mais le test Orchid élargirait considérablement la liste.

La société a été lancée ce mois-ci avec le soutien de scientifiques de Stanford et un financement de 4,5 millions de dollars d'investisseurs, notamment d'Anne Wojcicki, PDG de 23etmoi , qui fournit des tests génétiques grand public.

Avoir des enfants est le choix le plus conséquent que la plupart d'entre nous faisons, mais les parents entrent dans la grossesse sans aucune visibilité sur l'impact que les risques génétiques pourraient avoir sur leur futur enfant, a déclaré Noor Siddiqui, fondatrice et PDG d'Orchid. communiqué de presse .

Siddiqui, diplômé de Stanford et informaticien, voit les choses ainsi : un couple apprend qu'il court un risque élevé d'avoir un bébé atteint de diabète. Ils peuvent ensuite utiliser ces informations pour atténuer le risque de leur enfant. Cela pourrait signifier adopter un régime pauvre en sucre ou subir des examens de santé réguliers. Une autre option serait de poursuivre la FIV et d'utiliser le test d'Orchid pour sélectionner l'embryon présentant le risque de diabète le plus faible.

Le test pourrait être une perspective intéressante, en particulier pour les couples ayant des antécédents familiaux de diabète, de schizophrénie ou de l'une des autres conditions recherchées par Orchid. Mais la génétique derrière bon nombre de ces conditions est complexe et encore mal comprise.

Pour cette raison, de nombreux experts pensent que les scores de risque polygénique ne sont pas encore prêts pour les heures de grande écoute, et ils craignent que des entreprises comme Orchid ne survendent la technologie aux couples anxieux.

Au-delà des gènes uniques

L'introduction de tests consommateurs polygénétiques semble presque inévitable : générer des scores de risque pour la schizophrénie et d'autres conditions complexes est aller mieux grâce à une explosion de la quantité de données ADN disponibles. À l'aide de vastes bases de données génétiques de centaines de milliers de personnes, les chercheurs développent des algorithmes pour estimer le risque de diabète, de dépression, d'obésité et de certains cancers.

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Une autre startup, Genomic Prediction, a commencé à proposer des rapports sur les risques polygéniques en 2019 , tester des embryons pour les couples subissant une FIV. La société fournit des rapports sur les risques pour certaines des mêmes conditions multigéniques qu'Orchid.

Amit V. Khera, cardiologue au Massachusetts General Hospital et au Broad Institute, qui a développé des scores de risque polygénique pour les maladies cardiaques et d'autres affections, affirme que ces scores pourraient aider les adultes à atténuer leurs propres risques en faisant des choses comme changer leur alimentation ou faire plus d'exercice. Mais il ne pense pas que les scores soient prêts à être déployés pour la préconception et le dépistage des embryons sans autre considération.

D'une part, dit Khera, il n'y a qu'un nombre limité de risques que vous pouvez éliminer lorsque vous choisissez parmi des embryons provenant des mêmes parents.

Pour deux parents, la différence de risque entre les embryons ne sera pas si grande, dit-il. Si mon score est de 0 et que celui de ma femme est de 1, le score de mon enfant sera en moyenne d'environ 0,5. Vous pourrez peut-être trouver un embryon de 0,4 ou 0,6, mais ils ne seront pas si différents.

De plus, dit Khera, il existe de nombreuses variantes génétiques que les chercheurs ne comprennent tout simplement pas encore. Son groupe a trouvé des variantes qui semblent protéger contre les crises cardiaques mais augmentent le risque de diabète. En d'autres termes, il y a des compromis génétiques.

Le test d'Orchid pourrait également leurrer les parents dans un faux sentiment de sécurité que leurs futurs enfants ne développeront pas une maladie particulière. Par exemple, Patrick Sullivan, directeur du Center for Psychiatric Genomics de l'Université de Caroline du Nord, Chapel Hill, affirme que si la génétique joue un rôle dans la schizophrénie, la maladie n'est souvent pas héréditaire.

Les facteurs de risque les plus élevés que nous obtenons de la schizophrénie sont généralement des variantes de novo, ce qui signifie qu'aucun des parents ne les a, dit-il. C'est une mutation qui se développe dans la fabrication de l'enfant. C'est un événement aléatoire. Ces mutations de novo n'apparaîtraient pas sur le rapport de risque d'un couple généré par Orchid. Ils le feraient sur un rapport d'embryon, mais cela nécessiterait que les couples subissent une FIV et un dépistage des embryons.

Une autre limite des scores de risque polygénique actuels est que les ensembles de données sur lesquels ils s'appuient incluent principalement des personnes d'ascendance européenne. Historiquement, les études génétiques n'incluaient pas de personnes d'origines diverses.

Vous allez perdre en précision lorsque vous prenez ces scores et essayez de les utiliser sur d'autres groupes, explique Genevieve Wojcik, épidémiologiste en génétique à Johns Hopkins.

Choisir son meilleur embryon

À mesure que les scores polygéniques deviennent plus précis, sélection d'embryons peut offrir une chance de réduire la prévalence de certaines maladies courantes. Mais il y a une perspective plus controversée.

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Les mêmes techniques que les généticiens utilisent pour prédire ces maladies peuvent également être utilisées pour prédire des caractéristiques telles que intelligence ou le poids à l'âge adulte. Pour l'instant, Orchid se concentre sur la fourniture de rapports sur les risques de maladie aux parents, mais Genomic Prediction of New Jersey dépiste déjà les embryons pour la déficience intellectuelle.

Gabriel Lázaro-Muñoz, bioéthicien et avocat au Baylor College of Medicine qui a étudié les scores de risque polygénique, affirme que la capacité de dépister et de sélectionner des embryons pour un large éventail de traits vire au territoire de l'eugénisme. Nous devons avoir une conversation sérieuse sur la façon d'utiliser cette technologie dans notre société, dit-il.

Les attitudes négatives à l'égard de la maladie mentale sont déjà omniprésentes et les tests de risque polygéniques pourraient stigmatiser davantage ces conditions. L'idée qu'il est possible de choisir de réduire ou non le risque qu'un futur enfant souffre de telles conditions met beaucoup de pression sur les parents, dit-il. Au-delà de la question de la maladie mentale, les parents doivent-ils pouvoir choisir leur embryon le plus intelligent ?

Et même si les couples voulaient poursuivre le dépistage polygénique, les dépenses pourraient être prohibitives. Orchid n'a pas rendu public le coût de ses tests, mais une source a déclaré Examen de la technologie MIT qu'il facture 1 100 $ pour son rapport de couple. (Orchid n'a pas répondu à plusieurs tentatives d'entretien.) Bien que l'entreprise propose un programme d'aide financière aux couples qui ne peuvent pas se le permettre, il reste le prix de la FIV à prendre en compte. Un cycle de FIV coûte entre 12 000 et 17 000 dollars et tomber enceinte prend souvent plusieurs cycles.

C'est de la reproduction pour les riches, dit Laura Hercher , conseillère en génétique et directrice de recherche en génétique humaine au Sarah Lawrence College. Ce qu'ils semblent dire, c'est que tous ceux qui peuvent se le permettre devraient faire une FIV.

En effet, dans une interview en podcast, Siddiqui a suggéré que plus les couples devraient utiliser la FIV pour choisir leur embryon le plus sain s.

Hercher et d'autres se demandent si c'est la meilleure utilisation des scores de risque polygénique. Sommes-nous à l'aise de dire 'Laissons le marché décider pour quoi nous voulons tester les embryons' ? demande Hercher. Ou est-il temps d'intervenir et de dire 'Est-ce que toutes les utilisations de cela sont justifiées?'

Sauver une vie

Ce marché pour cette technologie est stimulé par la demande des parents, et pour certains, connaître les risques génétiques auxquels leur enfant est confronté pourrait être une aubaine.

Laura Pogliano dit qu'avoir un test comme celui d'Orchid aurait pu l'aider à mieux soutenir son fils Zac, qui a été initialement diagnostiqué avec un trouble obsessionnel-compulsif à l'adolescence en 2009. Alors que ses symptômes s'aggravaient, les médecins ont finalement déterminé qu'il souffrait de schizophrénie. Zac est décédé d'une insuffisance cardiaque en 2015, à l'âge de 23 ans. (On estime que 50 % des morts subites dans la schizophrénie proviennent de causes cardiovasculaires.)

Pogliano dit que si elle avait su le risque de son fils avant sa naissance, elle aurait pu rechercher les premiers signes et le faire soigner plus tôt. Les symptômes de la schizophrénie - hallucinations, délires, discours confus et pensée désorganisée - commencent généralement à apparaître dans la vingtaine, mais les changements dans le cerveau peuvent commencer plusieurs années plus tôt.

Elle dit que la maladie de Zac a aveuglé sa famille : avec la schizophrénie, vous pensez que vous avez un enfant en bonne santé, mais vous ne l'avez jamais fait. Le cerveau se prépare à cette maladie depuis des années.

Pogliano dit qu'elle aurait élevé son fils différemment si elle avait su qu'il était à haut risque. Elle aurait été plus vigilante quant à sa consommation d'alcool et de marijuana, qui peuvent altérer le système nerveux et déclencher des psychoses chez les personnes atteintes de schizophrénie.

Elle espère que le dépistage de la schizophrénie sera un jour routinier. C'est différent de deviner le risque de maladies comme les maladies cardiaques, le cancer du sein ou la maladie d'Alzheimer, dit-elle : ces maladies apparaissent beaucoup plus tard dans la vie, mais les parents ont la possibilité de faire une réelle différence dans la vie de leurs enfants s'ils connaissent leur risque de schizophrénie. .

Les bébés de créateurs ne sont pas la question, dit-elle. Tout ce que les parents veulent, c'est un chemin vers la santé pour leurs enfants.

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