Un texte médiéval d'exploration de données révèle des ingrédients médicalement bioactifs

le Lylye de Medicynes est un manuscrit du XVe siècle conservé à la Bodleian Library d'Oxford, en Angleterre. Il s'agit d'une traduction en moyen anglais d'un ancien traité latin sur la maladie, contenant des études de cas et des recettes de traitement. C'était un texte influent qui aurait appartenu à l'origine à Robert Broke, apothicaire personnel du monarque anglais Henri VI.

le Lylye de Medicynes est très familier aux historiens qui étudient les traitements médicaux médiévaux. Ils savent depuis longtemps que certaines recettes contiennent des ingrédients, comme le miel, aux propriétés antibiotiques.

Mais la question plus large de l'efficacité de la médecine médiévale en général est beaucoup plus difficile à étudier. La pharmacopée utilisée par les médecins et les profanes dans l'Europe médiévale a été largement rejetée comme un placebo ou une superstition, disent Erin Connelly de l'Université de Pennsylvanie et ses collègues de l'Université de Warwick au Royaume-Uni.

Maintenant, cette vue semble prête à changer. Connelly et sa compagnie disent que les recettes médiévales suivaient un schéma de traitement rationnel qui résiste à l'examen médical moderne. Leurs preuves proviennent de l'exploration de données sur les modèles d'ingrédients dans le Lylye de Médecine, qui révèle dans les recettes des réseaux de substances aux propriétés bioactives importantes.

Tout d'abord, un peu de contexte. le Lylye de Medicynes contient 360 recettes, chacune dans un format standard qui commence par le type de remède (un sirop ou un emplâtre pour pommade, par exemple), puis précise la phase de la maladie à laquelle il doit être appliqué et se termine par une liste d'ingrédients.

L'exploration de données de ce texte n'est pas une tâche facile. Les recettes mentionnent plus de 3 000 ingrédients pour le traitement de 113 affections différentes. Parmi ces conditions, 30 décrivent des symptômes tels que peau cassée, purulence, rougeur, croûte noire, odeur nauséabonde, chaleur ou brûlure, etc., qui se traduisent par des symptômes d'infections externes.

L'un des défis est que le texte fait souvent référence aux mêmes ingrédients en utilisant des mots et des orthographes différents. Par exemple, le fenouil aux herbes est appelé fenouil, feniculi, feniculum, marathri, maratri et maratrum. Ceux-ci doivent tous être condensés sous la même rubrique.

Cependant, différentes parties d'une plante peuvent contenir différents ingrédients actifs, et cela doit également être pris en compte. Ainsi, la racine de fenouil, le jus de fenouil et les graines de fenouil doivent tous être inclus séparément. L'équipe a également corrigé les variantes orthographiques à la main.

Après avoir standardisé les ingrédients, l'équipe a ensuite étudié les réseaux qu'ils formaient. Pour cela, ils ont créé un nœud pour chaque ingrédient et ont établi des liens entre eux s'ils apparaissaient dans la même recette. Plus ces ingrédients apparaissaient souvent ensemble, plus ce lien devenait fort. Après avoir assemblé le réseau, les chercheurs ont utilisé un algorithme standard pour rechercher des communautés au sein du réseau.

Les découvertes sont intéressantes à lire. Les résultats montrent clairement l'existence d'une structure hiérarchique au sein des recettes, affirment les chercheurs.

Chaque communauté du réseau est composée de communautés plus petites, toutes avec un noyau commun d'ingrédients. Par exemple, un noyau d'ingrédients se compose d'aloe vera et de sarcocolla nutria, une gomme provenant de l'un des nombreux arbres persans mélangée à du lait maternel.

Plusieurs ingrédients uniques jouent un rôle important dans le réseau. Ceux-ci incluent le miel, le vinaigre et les fleurs de grenade.

La prochaine étape de l'équipe était de rechercher des recettes emblématiques qui exploitent des combinaisons d'ingrédients. Ils ont ensuite recherché dans la littérature médicale moderne des preuves que ces recettes auraient pu fonctionner.

Par exemple, une recette dans le traité est un rince-bouche décrit comme un traitement pour les pustules, les ulcères, les apostèmes (gonflement/inflammation), le cancer, la fistule, l'herpestiomenus (gangrène) et le carbunculus (anthrax ; furoncle suppuré).

Cette concoction est faite avec du sumac, galle, psidia (l'écorce de grenade ou l'écorce de l'arbre), balaustia, mastic (résine exsudée de l'arbre à mastic, Lentisque pistache ), oliban, miel et vinaigre probablement mélangés avec du nitrite ou du lait maternel.

Une question importante est de savoir si l'un de ces ingrédients a des effets antibactériens ou immunomodulateurs. Pour le savoir, Connelly et ses collègues les ont consultés dans la base de données Cochrane des revues systématiques, une bibliothèque bien connue de recherche médicale fondée sur des preuves.

Il s'avère qu'il existe de bonnes preuves que certains de ces ingrédients sont bioactifs. Le miel est connu pour ses propriétés antibiotiques et le National Health Service du Royaume-Uni l'utilise régulièrement pour la cicatrisation des plaies. Le vinaigre est un bon désinfectant et le lait maternel contient une variété de composants antimicrobiens. La bile (ou galle) est également reconnue comme un puissant bactéricide.

Cependant, il existe peu de preuves que l'aloès, l'encens, le mastic et la sarcocolle ont des effets curatifs. Par exemple, une revue Cochrane des effets cicatrisants de l'aloès a révélé que les études pertinentes étaient généralement de mauvaise qualité. Donc, le jury n'est toujours pas sur le pouvoir de ces substances.

Néanmoins, combiner les ingrédients spécifiés dans un seul bain de bouche a clairement du sens. Selon Connelly et co .

Ils concluent que la recette du rince-bouche, et d'autres similaires, reflètent une approche rationnelle de la prise de décision médicale.

C'est un travail intéressant. Cela implique que la vision conventionnelle de la médecine médiévale comme un simple tour de passe-passe doit être repensée. Ce travail démontre la possibilité d'utiliser des algorithmes de réseaux complexes pour explorer un ensemble de données médicales médiévales pour les modèles sous-jacents dans les combinaisons d'ingrédients liés au traitement des maladies infectieuses, selon les chercheurs.

De plus, ils pensent qu'il pourrait y avoir beaucoup plus à découvrir dans les textes médiévaux, y compris la possibilité de nouveaux agents antimicrobiens encore inconnus de la science moderne. L'utilisation des technologies numériques pour transformer ces textes en bases de données se prêtant à l'exploration de données quantitatives nécessite une approche interdisciplinaire prudente, mais elle pourrait fournir une perspective entièrement nouvelle sur la science et la rationalité médiévales, disent Connelly et co.

Réf : https://arxiv.org/abs/1807.07127 : L'exploration de données d'un texte médical médiéval révèle des schémas dans le choix des ingrédients qui reflètent l'activité biologique contre les agents responsables d'infections spécifiées

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