Un test plus sûr pour le syndrome de Down

Depuis la découverte que le sang d'une femme enceinte contient des traces de l'ADN de son bébé, les chercheurs ont cherché des moyens de dépister cet ADN à la recherche d'anomalies génétiques. Un nouveau test développé par Stephen Quake et ses collègues de Université de Stanford nous rapproche un peu plus d'un test sanguin non invasif pour diagnostiquer des troubles comme le syndrome de Down chez un fœtus.

Trio de chromosomes : Les personnes atteintes du syndrome de Down ont trois copies du chromosome 21, plutôt que les deux standards.

Le nouveau test utilise de puissantes techniques de séquençage de l'ADN pour amplifier de courts fragments d'ADN d'un bébé à partir du sang de sa mère et pour cartographier les chromosomes. La méthode révèle les copies supplémentaires de chromosomes - aneuploïdie - caractéristiques de certains troubles génétiques, dont le syndrome de Down, dans lequel il existe trois copies du chromosome 21 au lieu de deux.

Maintenant, nous nous rapprochons du moment où il n'y aura pas de test de dépistage mais un test non invasif définitif, déclare Joe Leigh Simpson de Université internationale de Floride . Simpson n'était pas impliqué dans le travail de Quake.

Le test a détecté les neuf cas de syndrome de Down chez 18 femmes dans une étude publiée aujourd'hui dans le Actes de l'Académie nationale des sciences . Il a également détecté deux cas de syndrome d'Edward, dans lesquels il existe une copie supplémentaire du chromosome 18, et un cas de syndrome de Patau, caractérisé par trois copies du chromosome 13.

C'est très excitant, dit Farideh Bischoff , un cytogénéticien avec Biocepte , une société de biotechnologie basée à San Diego. C'est puissant. Bischoff n'était pas impliqué dans le travail de Quake.

Actuellement, l'étalon-or pour le diagnostic prénatal du syndrome de Down est l'amniocentèse, qui nécessite qu'une grosse aiguille soit enfoncée dans la mère juste à côté du bébé pour extraire un échantillon de liquide amniotique, explique Quake, qui est également chercheur pour le Institut médical Howard Hughes . Il existe un risque de fausse couche, d'infection ou de dommages au fœtus. Un diagnostic peut également être posé par un prélèvement de villosités choriales, qui utilise du tissu du placenta mais présente un risque de fausse couche plus élevé que l'amniocentèse. Les échantillons de liquide amniotique ou de placenta sont examinés pour voir si le fœtus a trois copies du chromosome 21.

La technique de Quake tire parti du fait que de petites quantités d'ADN d'un fœtus circulent dans le sang de sa mère. Une partie de l'ADN se trouve dans des cellules fœtales intactes, mais il y a une dizaine d'années, les chercheurs ont découvert que le sang d'une femme enceinte contenait également de l'ADN fœtal flottant librement. Contrairement aux cellules intactes, l'ADN fœtal acellulaire ne persiste pas d'une grossesse à l'autre. Il est également plus abondant que celui des cellules intactes, mais encore suffisamment rare pour le rendre difficile à détecter.

Quake et ses collègues ont prélevé des échantillons de sang sur des femmes enceintes considérées comme présentant un risque élevé de porter un bébé atteint d'aneuploïdie et ont utilisé un séquençage à haut débit pour amplifier des fragments d'ADN de la mère et du fœtus et pour cartographier ses chromosomes. Ils ont ensuite examiné la quantité de matériel de chaque chromosome. Une surabondance d'un chromosome particulier a indiqué un trouble génétique. Les résultats, selon Quake, peuvent être aussi précis que vous le souhaitez simplement en séquençant plus de fragments.

C'est un pas en avant, ajoute James Egan, président du département d'obstétrique et de gynécologie du Centre de santé de l'Université du Connecticut . Il a un grand potentiel, mais il n'est pas encore prêt pour le prime time. Egan n'a pas contribué à l'étude de Stanford. L'équipe de Quake prévoit maintenant une étude plus large sur plusieurs centaines de femmes enceintes.

Le coût du séquençage utilisé dans l'étude était de 700 $ par échantillon, mais Quake dit qu'il a depuis glissé à 300 $, car le coût de la technologie continue de baisser. Si cela peut vraiment être réalisé pour 700 $, cela pourrait révolutionner le domaine, dit Simpson.

L'équipe de Quake a testé des femmes au cours de leur deuxième trimestre de grossesse, bien qu'il pense que le test pourrait être utilisé dès 10 semaines de grossesse. Un test de dépistage du syndrome de Down au premier trimestre serait préférable, afin que les parents aient plus de temps pour décider s'ils souhaitent interrompre la grossesse ou se préparer à la naissance d'un bébé atteint de la maladie.

La méthode de Quake est l'une des différentes approches du problème de l'utilisation de l'ADN fœtal dans un test de diagnostic non invasif pour les troubles génétiques comme le syndrome de Down.

Sequenom , basée à San Diego, développe un test basé sur les gènes du chromosome 21 qui codent pour l'ARN spécifique du fœtus. Ces marqueurs peuvent être utilisés pour compter les copies du chromosome. Il existe des milliers de troubles génétiques qui peuvent facilement être diagnostiqués avec un dépistage génétique, explique Ravineur Dhallan , fondateur et PDG de Ravgen , une société de biotechnologie basée à Columbia, dans le Maryland, qui développe des tests de diagnostic utilisant l'ADN fœtal. Certains sont traitables aujourd'hui et beaucoup d'autres pourraient l'être à l'avenir.

On ne sait pas encore quelle méthode – ou quelles méthodes – finira par porter ses fruits. C'est comme des CD ou des DVD ou des clés USB, dit Egan de l'Université du Connecticut . Ce sont toutes des façons différentes d'aborder un problème. Un ou tous attireront l'imagination de la communauté médicale et deviendront un outil clinique très utile.

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