Transplanter des microbes intestinaux pour traiter la maladie

Plus tôt cet été, des scientifiques ont signalé le succès d'une greffe médicale inhabituelle ; une femme dont la vie est en danger Clostridium difficile infection a été traitée, et apparemment guérie, avec une injection de certaines des bactéries intestinales de son mari en bonne santé. Les chercheurs explorent maintenant plus en détail les effets de ce type de greffe. Ils espèrent éventuellement traiter un large éventail de maladies, des maladies intestinales à l'obésité, du diabète à la dépression, en manipulant les bactéries qui vivent dans l'intestin humain.

Les microbes qui habitent notre tube digestif, notre peau, notre bouche et d'autres parties du corps - connus collectivement sous le nom de microbiome humain - jouent un rôle clé dans la santé humaine, influençant le métabolisme, la fonction immunitaire, etc. (Chacun de nous contient environ 10 fois plus de cellules microbiennes que les cellules humaines.) Les scientifiques explorent un certain nombre de façons de manipuler ses microbes, notamment en mangeant des aliments tels que le yaourt qui contiennent des bactéries saines. Mais la transplantation de populations microbiennes entières peut fournir un moyen plus puissant de remanier nos écosystèmes intestinaux. Manger plus de yaourt, par exemple, n'a pas aidé les personnes souffrant de C. difficile infections, dit Rob Chevalier , professeur agrégé de chimie et de biochimie à l'Université du Colorado à Boulder.

Knight et ses collaborateurs de Barcelone, en Espagne, étudient les greffes de microbes chez les rongeurs dans l'espoir d'appliquer plus efficacement l'approche aux humains. Dans un article publié la semaine dernière dans la revue Recherche sur le génome , les chercheurs ont démontré qu'ils pouvaient transplanter avec succès l'ensemble de la communauté microbienne du système digestif d'un rat en bonne santé dans celui d'un autre. Après trois mois, le microbiome du receveur ressemblait davantage à celui du donneur, bien que les deux microbiomes ne soient pas identiques.

Ils ont également signalé que les antibiotiques, dont ils espéraient qu'ils faciliteraient la colonisation, entravaient en fait la croissance. Les animaux traités avec les médicaments avant la greffe se sont retrouvés avec un microbiome moins diversifié, qui ressemblait également moins à celui du donneur. Bien que la découverte doive être confirmée chez l'homme, elle suggère que les antibiotiques pourraient être contre-productifs dans le processus de transplantation, dit chevalier .

Contrairement aux greffes traditionnelles d'organes ou de tissus, les rats n'ont montré aucun signe de rejet. Nous n'avons rien remarqué. Ils n'étaient pas malades, pas même la diarrhée, dit Chaysavanh Manichanh , chercheur à l'Unité de recherche sur le système digestif de l'Institut de recherche de l'hôpital universitaire Vall d'Hebron à Barcelone et premier auteur de l'article.

Jo Handelsman , professeur au département de biologie moléculaire, cellulaire et du développement de l'Université de Yale, déclare que l'idée de transplanter un microbiome entier est très provocante, car nous ne comprenons pas encore quels microbes sont importants et lesquels ne le sont pas.

Parfois, lorsque nous essayons de définir chaque gène et chaque organisme qui doit être présent, des choses nous manquent. C'est l'attrait de prendre une vraie communauté et de tout transférer, dit-elle. À terme, nous aurons une meilleure idée des microbes les plus importants et de ce que nous pouvons manger – ou éviter de manger – pour favoriser la croissance et la stabilité de bonnes communautés microbiennes, dit-elle.

Les chercheurs ont initialement émis l'hypothèse que la transplantation serait facilitée en éliminant d'abord les microbes intestinaux du receveur avec des antibiotiques, selon Manichanh. Mais ils ont découvert que les antibiotiques étaient si puissants qu'ils interféraient avec l'établissement des nouvelles colonies microbiennes. Les rats qui n'ont pas reçu d'antibiotiques ont montré plus de changements dans leur flore que ceux qui en ont eu.

George M. Weinstock , professeur de génétique à l'Université de Washington à St. Louis et directeur associé du Genome Center de l'école, dit qu'il est trop tôt pour dire si une transplantation similaire fonctionnera chez l'homme et, le cas échéant, pour quelles maladies. Alors que des expériences anecdotiques ont montré que changer le microbiome d'une personne peut être un traitement contre la maladie, il manque des expériences définitives, dit-il.

David A. Relman , professeur de médecine et de microbiologie et immunologie à l'Université de Stanford, dit qu'il reste également à voir si la transplantation peut être standardisée pour produire des résultats fiables et reproductibles. Obtenir les microbes intestinaux de quelqu'un d'autre pourrait avoir un effet positif sur les troubles impliquant une prolifération bactérienne, mais pourrait également avoir des effets potentiellement dangereux. Cette nouvelle étude a suivi les rats pendant trois mois et a révélé que les nouvelles colonies de microbes étaient stables. Mais les études futures devront suivre les receveurs de greffe à plus long terme, dit Relman.

La prochaine étape de leurs recherches, selon Manichanh, consiste à voir si une greffe de microbiome peut affecter l'évolution de la maladie d'un animal malade. Elle et son équipe prévoient d'abord d'examiner le syndrome du côlon irritable. Ils travaillent déjà à cataloguer la diversité microbiotique des personnes atteintes de la maladie et espèrent associer des souches de bactéries spécifiques à la maladie.

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