Le moteur de recherche de maladies rares qui surpasse Google

À la fin des années 40, un professeur de la faculté de médecine de l'Université du Maryland a inventé une expression inhabituelle pour décrire des diagnostics inattendus. Lorsque vous entendez des bruits de sabots derrière vous, ne vous attendez pas à voir un zèbre, dit-il. L'expression est restée et aujourd'hui, les médecins utilisent couramment le terme zèbre pour décrire une maladie rare, généralement définie comme une maladie qui survient chez moins de 1 personne sur 2000 de la population.

Les maladies rares sont par nature difficiles à diagnostiquer. Selon l'Organisation européenne des maladies rares, 25 % des diagnostics sont retardés de 5 à 30 ans.

Il n'est donc pas surprenant que les médecins recherchent des moyens plus efficaces de faire le travail. Une aide de plus en plus courante dans ce processus est le moteur de recherche, généralement Google. Cela fait partie d'un processus itératif dans lequel un médecin saisit des symptômes dans un moteur de recherche, examine des listes de maladies potentielles, puis recherche d'autres preuves de symptômes chez le patient.

Le problème, bien sûr, est que les moteurs de recherche communs ou de jardin ne sont pas optimisés pour ce processus. Google, par exemple, considère les pages importantes si elles sont liées par d'autres pages importantes, base de son célèbre algorithme PageRank. Cependant, les maladies rares, par définition, sont peu susceptibles d'avoir une grande visibilité sur le Web. De plus, les recherches sont susceptibles d'être entachées de retours de toutes sortes de sources non pertinentes.

Aujourd'hui, Radu Dragusin de l'Université technique du Danemark et quelques potes dévoilent une alternative. Ces gars-là ont mis en place un moteur de recherche sur mesure dédié au diagnostic des maladies rares appelé TrouverZebra , un nom basé sur l'argot médical commun pour une maladie rare. Après avoir comparé les résultats de ce moteur avec les mêmes recherches sur Google, ils montrent qu'il est nettement meilleur pour renvoyer des résultats pertinents.

La sauce magique dans FindZebra est l'index qu'il utilise pour rechercher des résultats. Ces gars-là ont créé cet index en explorant un ensemble spécialement sélectionné de bases de données sur les maladies rares. Ceux-ci incluent le L'héritage mendélien en ligne chez l'homme base de données, la Centre d'information sur la génétique et les maladies rares et Orphanet .

Ils utilisent ensuite l'outil de recherche d'informations open source Indri de rechercher cet index via un site Internet avec une interface de moteur de recherche classique. Le résultat est FindZebra.

Enfin, ils ont comparé les résultats des recherches sur FindZebra avec la même recherche sur Google appliquée au même ensemble de données limité, une fonctionnalité qui est possible avec les recherches avancées de Google. Dragusin et ses collègues disent que les résultats de Google sont nettement pires que les leurs.

Par exemple, sur FindZebra, la requête de recherche Garçon, naissance normale, déformation des deux gros orteils (articulation manquante), développement rapide d'une tumeur osseuse près de la colonne vertébrale et ostéogenèse à la biopsie renvoie le diagnostic correct Fibrodysplasia ossificans progressiva comme premier résultat. Cependant, ce diagnostic n'apparaît pas du tout dans les résultats de tout type de recherche Google.

Cela indique que l'algorithme PageRank, ou du moins la façon dont Google l'a modifié, n'est pas adapté à ce type de recherche. Notre conclusion, selon laquelle FindZebra surpasse Google dans l'ensemble pour cette tâche et en particulier lorsqu'elle est limitée aux sites de notre collection (Google Restricted), suggère que l'algorithme de classement de Google est sous-optimal pour la tâche à accomplir, concluent-ils.

Bien qu'il s'agisse encore d'un projet de recherche, Dragusin et co ont rendu leur moteur de recherche sur les maladies rares accessible au public à l'adresse www.findzebra.com . Cela pourrait clairement devenir un outil précieux pour la communauté médicale.

Ce qui est moins clair, en revanche, c'est comment cet outil sera utilisé par le grand public. Le site est livré avec le message désespéré : Avertissement! FindZebra est un projet de recherche et il doit être utilisé seul par des professionnels de la santé.

FindZebra pourrait évidemment être la charte d'un hypocondriaque. D'un autre côté, c'est vrai pour n'importe quel dictionnaire médical.

Le public averti consulte de plus en plus son médecin armé d'informations détaillées téléchargées sur Internet. Toute initiative visant à améliorer la qualité de cette information doit certainement avoir une valeur significative.

Réf : arxiv.org/abs/1303.3229 : FindZebra : un moteur de recherche pour les maladies rares

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