211service.com
Le gouvernement britannique choisit Illumina pour séquencer 100 000 génomes
Le gouvernement britannique a annoncé son intention d'embaucher la société américaine de séquençage génétique Illumina pour séquencer 100 000 génomes humains dans le cadre de ce qui est le plus grand projet national de décodage de l'ADN d'une population.
Machine à gènes : Un instrument de séquençage d'Illumina peut décoder un génome en une journée.
Dans un dossier réglementaire avec la Securities and Exchange Commission des États-Unis, Illumina a déclaré qu'il avait été choisi comme partenaire privilégié pour le projet de 100 millions de livres sterling.
Genomics England a confirmé avoir choisi la société californienne pour réaliser le projet de séquençage. Nous avons suivi le processus de « bake-off » pour trouver la bonne entreprise pour effectuer le séquençage, et nous allons maintenant entamer des négociations détaillées, a déclaré Vivienne Parry, porte-parole de Genomics England.
Les instruments de séquençage d'Illumina dominent le marché du décryptage de l'ADN (voir 50 entreprises les plus intelligentes). Parry dit que moins de cinq autres entreprises ont soumissionné pour le travail, l'un des plus grands projets de séquençage jamais entrepris.
Certains autres pays envisagent également de grands projets nationaux de séquençage. Le projet britannique se concentrera sur les personnes atteintes de cancer, ainsi que sur les adultes et les enfants atteints de maladies rares. Étant donné que tous les Britanniques sont membres du National Health Service, le projet espère pouvoir comparer les données ADN avec des dossiers de santé centralisés détaillés (voir Why the U.K. Wants a Genomic National Health Service ).
Alors que le nombre de génomes à séquencer est de 100 000, le nombre total de Britanniques participant à l'étude est plus petit, environ 70 000. En effet, pour les patients atteints de cancer, Genomics England a l'intention d'obtenir la séquence de leur ADN hérité ainsi que celle de leurs cancers.
Genomics England a commencé à discuter au début de cette année avec des soumissionnaires potentiels, dont la société chinoise et le rival d'Illumina BGI (voir Inside China's Genome Factory). À l'époque, le coût moyen pour compléter un génome était d'environ 3 000 $ à 4 000 $.
Compléter les 100 000 génomes aurait coûté plus du double du budget de Genomics England. L'agence a déclaré en décembre qu'elle avait l'intention d'utiliser son pouvoir de négociation pour faire baisser les prix.
Illumina a réagi en lançant un nouveau système, le Hiseq X Ten, qui, selon elle, serait capable de séquencer des génomes pour 1 000 $ chacun, franchissant une barrière de prix tant attendue (voir Illumina a-t-il le premier génome de 1 000 $ ?).
Ce système est en fait composé de 10 machines, chacune coûtant 1 million de dollars. En obligeant les acheteurs à investir au moins 10 millions de dollars dans l'équipement, Illumina s'est assuré que la baisse des coûts de son nouveau système n'affecte pas largement les prix dans d'autres parties du marché du séquençage, tout en lui permettant de capturer de gros emplois nationaux comme celui du Royaume-Uni.
Selon les utilisateurs du nouveau système Illumina, le prix par génome est toujours plus proche de 2 000 $ que de 1 000 $.
Parry dit qu'Illumina effectuera le séquençage au nom de Genomics England, et que les deux finaliseraient les négociations au cours des deux prochaines semaines. C'est un projet extrêmement excitant qui est à la pointe de la technologie. Ce n'est pas quelque chose que les gens ont fait auparavant, dit Parry. Nous serons aux limites de la technologie.
[Mise à jour du 12/07/14 : Illumina réalisera le séquençage pour le compte de Genomics England de 100 000 génomes. Une version antérieure de cet article disait à tort que Genomics England avait l'intention de séquencer l'ADN de 100 000 individus distincts et qu'elle le ferait elle-même avec des instruments achetés auprès d'Illumina.]