Gut Check : les scientifiques se méfient des tests de microbiome à domicile

Cellules intestinales humaines avec bactéries intestinales. Des changements dans certaines populations bactériennes dans l'intestin ont été attribués à un large éventail de maladies. Avec l'aimable autorisation du Laboratoire national du nord-ouest du Pacifique

L'idée que différents types de bactéries dans l'intestin humain jouent un rôle dans la santé et la maladie est à l'origine d'une nouvelle tendance dans les trousses de soins de santé axées sur le consommateur.

Les startups proposent de nouveaux services pour analyser la communauté complexe de micro-organismes vivant dans le tube digestif, appelée microbiome. Les clients reçoivent des tubes à essai par la poste et les renvoient avec des écouvillons fécaux à analyser en laboratoire. Les entreprises disent qu'elles peuvent faire des choses comme faire des recommandations diététiques et prédire le risque de certaines maladies en fonction de la composition microbienne unique d'une personne.

Bien que ces tests puissent probablement indiquer si vous avez une infection bactérienne grave, les scientifiques disent qu'ils ne peuvent pas encore diagnostiquer les patients atteints de maladies et ils doutent que les tests puissent fournir de manière fiable le type d'informations personnalisées que leurs fabricants prétendent qu'ils fourniront.

L'enthousiasme de leurs fabricants va tout simplement bien au-delà de l'état actuel de la science, déclare Rob Knight, chercheur de premier plan sur le microbiome et professeur à l'Université de Californie à San Diego. Knight est le cofondateur du projet américain Gut, une étude financée par la foule pour cartographier l'intestin humain.

Ces dernières années, les chercheurs ont découvert que les changements dans les écosystèmes microbiens du corps sont liés à toute une gamme de conditions médicales différentes, des problèmes gastro-intestinaux au diabète et même à la maladie de Parkinson. Knight dit qu'il existe un grand potentiel pour développer des diagnostics basés sur le microbiome à l'avenir, c'est pourquoi tant d'enthousiasme existe pour ces nouveaux tests.

Une nouvelle startup, Thryve, a commencé à proposer un service d'abonnement mensuel aux tests de microbiome en février à partir de 59,95 $ par mois. Le PDG Richard Lin dit que la société utilise l'apprentissage automatique pour générer des rapports personnalisés montrant la décomposition des bactéries intestinales d'une personne. Les rapports donnent également des conseils tels que les aliments fibreux à manger ou les probiotiques à boire pour améliorer les bonnes bactéries. Les clients ont accès à une plateforme en ligne avec un chatbot qui leur pose des questions sur ce qu'ils ont mangé ce jour-là et s'ils ont fait de l'exercice ou pris des compléments alimentaires.

Pendant ce temps, la société uBiome, basée à San Francisco, a lancé un service en novembre qui détecte les micro-organismes susceptibles de contribuer aux symptômes intestinaux courants, notamment la constipation, les ballonnements, la diarrhée et les gaz. Appelé SmartGut, il ne peut être commandé que par un professionnel de la santé et est entièrement ou partiellement couvert par la plupart des compagnies d'assurance maladie.

uBiome, basé à San Francisco, a lancé en novembre SmartGut, un test de microbiome qui peut être commandé par les médecins. Avec l'aimable autorisation de uBiome

La PDG Jessica Richman a déclaré que le test compare les microbiomes des patients à des microbiomes sains sur la base de l'ensemble de données de l'entreprise et d'études scientifiques évaluées par des pairs afin de déterminer les facteurs de risque de maladies telles que le diabète, l'obésité et les calculs rénaux.

Nous avons choisi ces conditions spécifiques car nous pensons qu'il existe suffisamment de données pour étayer la présentation d'un facteur de risque. Actuellement, nous ne diagnostiquons aucune maladie par des tests ; nous offrons simplement des facteurs de risque qui font partie de l'image pour le médecin et le patient, dit Richman. La société développe également des tests de diagnostic qui devront obtenir l'approbation de la Food and Drug Administration des États-Unis.

Knight dit que ce que les gens peuvent raisonnablement s'attendre à apprendre de ces nouveaux tests commerciaux ressemble davantage à un instantané de la façon dont le microbiome d'un participant se compare à d'autres ayant des régimes, des âges et des modes de vie différents, ou dans différents endroits du monde. Le projet américain Gut donne ce type d'analyse sans faire de prédictions de risque de maladie ni donner de conseils de santé.

En effet, nous ignorons beaucoup de choses sur le microbiome et son lien avec notre santé. Jack Gilbert, directeur de la faculté du Microbiome Center de l'Université de Chicago, affirme que de nombreuses études à ce sujet ont été menées sur de petits groupes de patients et n'indiquent que des relations corrélatives, et non causales. Par exemple, on pense qu'un manque de diversité dans les types de bactéries dans l'intestin est associé à la maladie.

Gilbert dit qu'il pourrait être possible de découvrir comment le microbiome affecte la maladie d'une personne ou de faire des recommandations diététiques personnalisées, mais cela nécessiterait beaucoup plus de données et de surveillance sur plusieurs mois, voire des années. Pour que les entreprises le fassent bien, estime-t-il, cela coûterait aux consommateurs 5 000 à 6 000 $.

Le moyen idéal d'observer de tels changements serait dans une étude à long terme où les gens sont inscrits avant de tomber malades, puis étudiés au fur et à mesure qu'ils tombent malades afin que les chercheurs puissent tester s'ils peuvent prédire la maladie à partir de changements dans le microbiome avant qu'ils ne surviennent, Knight dit.

En ce qui concerne les régimes, la plupart des gens n'ont probablement pas besoin d'un test de microbiome pour leur dire de manger plus sainement, déclare Gary Wu, professeur de gastro-entérologie à l'Université de Pennsylvanie et membre du conseil consultatif scientifique de l'American Gastroenterological Association Center for Gut Microbiome Research & Éducation.

Cela ne signifie pas que les gens ne devraient pas faire séquencer leurs microbiomes. Knight dit que les gens devraient le faire s'ils souhaitent en savoir plus sur les différentes espèces de bactéries qui composent leur microbiome. Et Wu est enthousiasmé par ces types de tests axés sur le consommateur, car ils engagent le profane dans la science.

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