Comment la cryptographie garantira la confidentialité génomique

La plupart des habitants du monde développé pourront bientôt se permettre de séquencer leur propre génome. L'objectif de faire cela pour moins de 1 000 $ devrait être atteint d'ici un an avec la possibilité de génomes inférieurs à 100 $ d'ici 5 ans.

Les avantages sont légion puisque les médicaments peuvent être adaptés à chaque patient.

Mais il y a aussi de sérieuses inquiétudes. Votre génome révélera beaucoup de choses sur vous : votre risque de diverses maladies, votre passé ancestral et votre phénotype ; la couleur des yeux et des cheveux et ainsi de suite.

Donc, une question importante est la confidentialité. Il va de soi que les individus voudront garder privés les résultats de tests tels que ceux qui déterminent le risque de maladie, si les enfants sont susceptibles d'hériter de certaines maladies et des tests de paternité.

Divers groupes développent des techniques pour créer ce niveau de confidentialité et aujourd'hui, Pierre Baldi et ses collègues de l'Université de Californie à Irvine révèlent un certain nombre de façons de garder secrets les résultats de certains tests génétiques.

Ils se sont particulièrement penchés sur les tests de paternité, les tests de compatibilité (si les conditions pouvaient être transmises aux enfants) et le risque de contracter certaines maladies. Le scénario qu'ils imaginent est que chaque individu aura son propre génome stocké sur un PC ou un smartphone. Ils pourraient alors accéder à un service en ligne qui examine le génome ou le compare à un autre et renvoie les résultats.

La question ici est de savoir qui devrait avoir accès aux données. Baldi et co partent de l'hypothèse que seuls les propriétaires du génome devraient avoir accès à leurs données génomiques et aux résultats. Ainsi, le prestataire de services ne peut pas voir les génomes impliqués ou les résultats.

Il s'avère qu'il existe différents algorithmes qui permettent déjà ce type de transaction « boîte noire ». L'idée de base est d'utiliser des techniques de cryptage standard pour garantir que seuls ceux qui possèdent la clé requise peuvent voir les données ou les résultats de tout calcul. Cela peut garantir la confidentialité contre toutes les attaques, sauf les plus déterminées et les plus riches en ressources.

Tout cela est un truc assez standard. Le travail de Baldi and co teste essentiellement la vitesse à laquelle les tests peuvent être effectués, la première fois que cela a été fait avec des données génomiques complètes.

Ils concluent que ce niveau de confidentialité est désormais possible. Ils disent également que ces tests pourraient être effectués dans un délai raisonnablement court, en fonction de la quantité de données génomiques impliquées. Les exemples sur lesquels ils travaillent prennent entre quelques millisecondes et plus d'une heure.

La protection de la vie privée est une question qui est susceptible de devenir de plus en plus visible dans le débat public. Plusieurs entreprises proposent déjà des tests génomiques, mais la question de la confidentialité a pris le pas sur des questions telles que la précision et le coût. Étant donné que nous avons déjà la capacité d'améliorer la confidentialité, cela devrait changer le plus tôt possible.

Réf : arxiv.org/abs/1110.2478 : Contrer GATTACA : Tester efficacement et en toute sécurité des génomes humains entièrement séquencés

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