211service.com
Cellules comme circuits
Source : Effat Emamian et Ali Abdi
La carte du génome humain devait déclencher une révolution dans la découverte de médicaments. Mais le comportement des cellules est déterminé par les interactions de centaines de protéines différentes dans ce que l'on appelle les voies de signalisation, et déterminer quelles interactions tournent mal dans la maladie s'est avérée beaucoup plus difficile que les gens ne le pensaient.
Cette histoire faisait partie de notre numéro de janvier 2009
- Voir le reste du numéro
- S'abonner
Aujourd'hui, une étude menée par des scientifiques affiliés au New Jersey Institute of Technology (NJIT) a utilisé l'analyse de circuits pour identifier les molécules qui jouent le plus grand rôle dans les voies de signalisation des cellules. Les chercheurs pensent que leur travail peut faire gagner du temps et de l'argent aux chercheurs sur les médicaments en identifiant des cibles médicamenteuses prometteuses.
Le schéma ci-dessus ne représente que la moitié d'une voie qui régule la production d'une molécule appelée CREB (rouge), qui est impliquée dans la formation de la mémoire. La voie est représentée comme un ensemble de portes logiques, éléments de base des circuits numériques. Une porte OU, par exemple, produit une sortie si elle reçoit l'une de ses entrées : ici, cela signifie que l'une des deux molécules régule la production de la molécule suivante dans la voie. Bien que chaque étape du parcours ait été bien étudiée dans les laboratoires de biologie, le schéma fournit un achat quantitatif sur l'ensemble du réseau.
Une molécule de ce réseau, PP2B (bleu), est à l'étude comme cible de médicaments contre la schizophrénie. Mais l'analyse des chercheurs montre que PP2B est moins important pour la régulation du CREB que les canaux calciques de type P/Q (orange). PP2B joue un rôle dans de nombreuses autres voies, donc le cibler pourrait avoir des effets secondaires malheureux. Les canaux calciques sont la cible de médicaments déjà approuvés pour d'autres troubles, ils peuvent donc également être une cible plus sûre pour les médicaments contre la schizophrénie.
Les chercheurs ont appliqué leur approche à trois voies de signalisation différentes et leurs prédictions concordaient avec les résultats expérimentaux. Effat Emamian, qui a dirigé la recherche, a fondé une société qui commercialise des analyses de voies de signalisation auprès des sociétés pharmaceutiques.