Cartographier les maladies infectieuses

Vous vous demandez quel État ou pays a été le plus durement touché par l'épidémie de salmonelle ou où les derniers cas ont été détectés ? Vous pouvez vous renseigner sur Carte Santé , un système de surveillance de la santé publique qui parcourt les sites d'actualités Internet et d'autres sources pour obtenir des informations en temps réel sur les épidémies de maladies infectieuses, puis trace ces données sur une carte du monde librement accessible.

Suivi de la maladie : HealthMap est un outil de surveillance automatisé disponible gratuitement, utilisé pour suivre les épidémies de maladies infectieuses dans le monde. Les utilisateurs peuvent rechercher des rapports basés à la fois sur le pays et le type de maladie qui les intéresse. Voici un gros plan de la partie orientale des États-Unis, avec des rapports récents de cas de salmonelles mis en évidence avec des ballons colorés. Les bulles sont codées par couleur en fonction de l'heure du rapport, le rouge étant le plus récent. Cliquer sur le ballon orange dans le Massachusetts, par exemple, ouvrirait un article du 8 juillet d'une chaîne d'information de Boston faisant état de trois nouveaux cas liés à l'épidémie de salmonelle.

Le logiciel HealthMap collecte d'abord des informations provenant de diverses sources, notamment des alertes de l'Organisation mondiale de la santé, des discussions sur des listes de diffusion de santé publique et des informations de dernière minute provenant de milliers de sites Web dans six langues différentes du monde entier.

Une série d'algorithmes de traitement de texte sélectionne ensuite la maladie signalée et le lieu de l'événement, et essaie de déterminer sa pertinence. Par exemple, le logiciel doit faire la distinction entre un fait divers sur la tuberculose et un article sur une campagne de vaccination contre la tuberculose. John Brownstein , cofondateur de HealthMap et professeur adjoint au programme d'informatique de l'hôpital pour enfants de Boston, affirme que le taux d'algorithmes rapporte correctement environ 95 % du temps.

Les données sont tracées sur une carte du monde, avec différentes couleurs indiquant les rapports les plus récents. Il est très utile de pouvoir voir ces choses dans une représentation spatiale - cela nous aide à reconnaître quand une maladie se propage, quand il y a un groupe de cas et quand différents cas peuvent être liés, explique Larry Madoff, médecin à la Harvard Medical School. , à Boston, et rédacteur en chef de ProMED , une liste de diffusion de santé publique gérée par la Société internationale pour les maladies infectieuses.

L'un des avantages de cette approche automatisée est la rapidité : les organes de presse locaux et les discussions sur les listes de diffusion détectent souvent les cas avant les canaux officiels de santé publique. Nous détecterons un cas de grippe aviaire en Indonésie, puis quelques jours plus tard, nous verrons une confirmation officielle de l'Organisation mondiale de la santé, a déclaré Brownstein. Le site est entièrement automatisé et est mis à jour toutes les heures, 24 heures sur 24.

Les voyageurs du monde entier peuvent consulter la carte pour rechercher de nouvelles épidémies dans leurs destinations de vacances. Mais dans une perspective plus large de santé publique, les chercheurs affirment que le système est susceptible d'être le plus utile dans les pays les plus pauvres, qui ont peu de surveillance de la santé publique et sont souvent un foyer de maladies infectieuses. Alors que dans des pays comme les États-Unis, où les responsables de la santé publique surveillent les visites aux urgences locales et d'autres indicateurs de signes d'épidémie, de nombreux pays en développement n'ont pas la capacité de faire de la surveillance, explique Brownstein. Dans ces cas, les médias d'information ont tendance à être une bonne source de données. En revanche, les régions qui supportent le plus grand fardeau de maladies infectieuses, y compris de grandes parties de l'Afrique et de l'Amérique du Sud, ont moins de médias et donc les plus grandes lacunes dans la couverture.

Ces sources deviennent particulièrement importantes lorsqu'un pays essaie de garder secrètes les informations de santé publique pour des raisons économiques ou politiques, selon les experts. Une épidémie de choléra impose des restrictions sur le commerce et le tourisme qui sont mauvaises pour le pays, donc ils pécheront par excès de prudence, dit Madoff. Mais du point de vue de la santé publique, il peut être plus important d'agir plus tôt uniquement en cas de suspicion [d'épidémie].

L'utilisation par HealthMap de sources dites informelles s'appuie sur une tendance croissante. Les reportages, les articles de blog et diverses autres sources sont devenus des sources d'information plus importantes pour la santé publique, explique Madoff. Par exemple, les premières indications de l'épidémie de SRAS en Chine étaient évidentes dans les discussions locales sur ProMED, un système de notification par courrier électronique, bien avant que l'épidémie ne fasse les gros titres du monde. HealthMap utilise ProMED, qui a été développé il y a plus d'une décennie et a été le premier à tirer parti d'Internet pour suivre les maladies infectieuses, comme l'une de ses sources de données.

Mais avec l'élargissement du réseau d'informations utilisé par des ressources comme HealthMap, l'exactitude de ses données s'inquiète. Étant donné que les informations sont basées sur des rapports passés au peigne fin sur Internet, il peut y avoir quelque chose de perdu dans la traduction, dit Arnold Monto , épidémiologiste à l'École de santé publique de l'Université du Michigan, à Ann Arbor. Cela deviendra une préoccupation encore plus importante à mesure que les chercheurs de HealthMap commenceront à explorer un éventail encore plus large de sources. C'est une considération majeure alors que nous entrons dans les blogs et les salons de discussion, dit Brownstein. Nous passons beaucoup de temps à réfléchir à la validité et à la fiabilité des sources.

HealthMap collabore également avec ProMED, qui est arbitré par des experts ; une équipe de spécialistes surveille les nouvelles mondiales et les rapports des utilisateurs et les envoie à la liste de diffusion. Les chercheurs visent à capturer le meilleur des deux mondes, en utilisant la technologie automatisée de HealthMap pour collecter rapidement des données et les experts humains de ProMED pour conserver ces informations.

Certains voient le large réseau de HealthMap comme un avantage. Je pense que c'est l'orientation future de l'épidémiologie des maladies infectieuses, dit Poisson Durland , épidémiologiste à la Yale School of Public Health, à New Haven, Connecticut, qui a déjà travaillé avec Brownstein. Cela va au-delà des rapports de cas humains traditionnels, ce que nous avons fait dans le passé, dit-il. Par exemple, le logiciel peut récupérer des rapports de scientifiques travaillant en dehors du domaine de la santé publique, identifiant peut-être un nouveau virus animal susceptible de se propager à l'homme. Cela pourrait éventuellement donner aux responsables de la santé publique le pouvoir d'intervenir avant une épidémie. Nous serions en mesure d'identifier où ce virus est susceptible d'émerger chez l'homme, explique Fish. Une fois que nous aurons le premier cas humain, nous saurons que le virus a fait le saut. C'est probablement ce qui s'est passé avec le SRAS.

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