23andMe réalise une étude massive et participative sur la dépression

Une expédition scientifique dans l'ADN de plus de 450 000 clients de la société de tests génétiques 23andMe a découvert le premier trésor majeur d'indices génétiques sur la cause de la dépression.

L'étude, la plus importante du genre, a détecté 15 régions du génome humain liées à un risque plus élevé de lutter contre une dépression grave. L'étude a été réalisée par le géant pharmaceutique Pfizer dans le cadre d'une alliance avec 23andMe, la société californienne dont les rapports génétiques ont été achetés par plus de 1,2 million de personnes (voir '50 Smartest Companies 2016 : 23andMe').

Jusqu'à présent, la grande majorité des efforts pour localiser les risques génétiques de dépression ont échoué, probablement parce que les efforts ont été trop limités pour trouver quoi que ce soit.

Tout le monde reconnaît qu'il s'agit d'un problème de chiffres, déclare Ashley Winslow, anciennement neuroscientifique chez Pfizer et maintenant directrice de la neurogénétique au Orphan Disease Center de l'Université de Pennsylvanie. Winslow a dirigé l'effort de recherche. Il est difficile, voire impossible, d'obtenir les chiffres que nous avons vus dans l'étude 23andMe.

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Nombre de clients 23andMe signalant un diagnostic de dépression.

Les résultats ont émergé de ce qu'on appelle une étude d'association à l'échelle du génome. Dans cette approche, l'ADN de nombreuses personnes atteintes d'une maladie est comparé à celui de témoins sains, à l'aide d'une recherche informatisée. Toute différence génétique apparaissant plus souvent chez les personnes malades peut indiquer quels gènes sont impliqués.

Cette tactique de chasse aux gènes a permis de mieux comprendre le diabète, la schizophrénie et d'autres maladies courantes. Mais la dépression est restée pratiquement intacte jusqu'à présent. Auparavant, une étude portant sur 6 000 femmes chinoises gravement déprimées avait localisé deux signaux dans le génome, mais d'autres enquêtes se sont révélées vides.

La grande histoire est que 23andMe nous a permis de franchir le point d'inflexion de la dépression, déclare Douglas Levinson, psychiatre et chercheur en génétique à l'Université de Stanford impliqué dans le Psychiatric Genomics Consortium, un autre groupe de chasse aux gènes. C'est excitant. Cela nous rend optimistes que nous y sommes enfin.

23andMe a vendu plus d'un million de kits de tests génétiques. Le produit, qui coûte 199 $, est principalement destiné au divertissement, comme découvrir son origine ethnique. Mais plus de la moitié de ses clients ont accepté d'autoriser l'utilisation de leur ADN dans d'autres recherches et de répondre à des questions d'enquête sur leur santé.

Grâce à ses enquêtes, l'entreprise a pu localiser plus de 141 000 personnes qui ont déclaré avoir reçu un diagnostic de dépression. C'est environ 10 fois plus que la prochaine plus grande étude sur la dépression jamais réalisée, dit Levinson. Les données ADN de 337 000 autres clients de 23andMe qui n'ont signalé aucune dépression ont été utilisées comme témoins.

Le besoin de bases de données toujours plus volumineuses est vivement ressenti par les généticiens. À leur demande, le gouvernement américain a commencé cette année à mettre en œuvre des plans pour une base de données sur la médecine de précision d'un million de personnes. Le risque génétique de dépression est en fait dû à des centaines de gènes, chacun ayant un très petit effet.

Les auteurs du rapport ont qualifié cette découverte d'approbation des données de 23andMe. Mais Levinson a noté que la dépression est également le cas de test parfait pour une base de données de consommateurs. C'est une maladie courante et n'est plus très stigmatisée, donc les gens sont prêts à dire qu'ils l'ont. Mais d'autres affections psychiatriques sont beaucoup moins fréquentes. S'ils essayaient de le faire dans la schizophrénie ou l'anorexie, ils échoueraient probablement, dit Levinson. C'est la mise en garde ici.

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