1 000 $ de génome en deux heures d'ici 2012, déclare le PDG d'Ion Torrent

Le génome mythique de 1 000 $ est presque à nos portes, a déclaré Jonathan Rothberg, PDG de la société de technologie de séquençage Ion Torrent, lors de la conférence Emerging Technology du MIT. Si sa prédiction se réalise, cela représentera un triomphe étonnant dans le développement technologique rapide. Le rythme auquel le séquençage du génome est devenu plus abordable est plus rapide que la loi de Moore . (Vous pouvez lire un Q&R ENFANTS fait avec Rothberg plus tôt cette année ici, et un profil de son entreprise ici).

Jonathan Rothberg, directeur d'Ion Torrent, s'exprimant à EmTech 2011

À cette époque, l'année prochaine, le séquençage des génomes humains sera aussi rapide et bon marché que le génome bactérien, a déclaré Rothberg. (Auparavant, il avait déclaré que son entreprise pouvait désormais créer un génome bactérien entier en deux heures environ.)

J'étais dans la salle le 19 octobre lorsqu'il l'a dit, et j'aurais pensé qu'il s'agissait d'un pur orgueil s'il n'y avait pas eu l'incroyable expérience de Rothberg dans ce domaine, de la fondation de la société de séquençage de la génération précédente 454 Life Sciences aux récentes percées réalisées avec le la même technologie qu'il propose nous amènera au génome de 1 000 $.

Cette technologie, appelée, appelée la Machine personnelle de génome , est déjà utilisé pour déterminer quelles mutations sont présentes dans les génomes des cancers des patients .

Le Personal Genome Maker fait déjà son apparition dans les laboratoires cliniques, voire dans les cabinets de médecins

La clé de cette percée, dit Rothberg, est que le PGM ne s'appuie pas sur la chimie humide conventionnelle pour séquencer l'ADN. Au lieu de cela, il fonctionne presque entièrement à travers technologie conventionnelle des puces électroniques , ce qui signifie qu'Ion Torrent s'appuie sur des décennies d'investissement dans des transistors et des puces conventionnels.

Alors, à quoi ressemble l'âge du génome de 1 000 $ ? Jusqu'à ce que nous sachions avec quoi ces gènes sont réellement corrélés, pour la plupart d'entre nous, ce ne sera pas si différent du présent.

À l'heure actuelle, il n'y a pas beaucoup de corrélations entre ces 3 milliards de paires de bases [du génome humain] et les résultats ou les médicaments, dit Rothberg. Il prédit qu'il faudra au moins 10 ans d'expériences cliniques avec le séquençage complet du génome pour nous amener au point où nous pouvons commencer à débloquer sa valeur.

Et il faudra 20 ans avant que nous comprenions le cancer au même niveau que le VIH et que nous puissions proposer des combinaisons de médicaments [sur mesure] pour chaque individu, dit Rothberg.

Vous pouvez regarder une vidéo complète de son discours sur le site EmTech de Tech Review.

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